Sơ đồ cơ cấu tổ chức và các phòng ban chức năng và chuyên môn
BAN LÃNH ĐẠO VIỆN
| Stt | Họ và tên | Chức vụ | Chuyên môn |
| 1 | PGS.TS. Lưu Thế Anh | Viện trưởng | Địa Lý Tài nguyên và Môi trường |
| 2 | TS. Võ Thanh Sơn | Phó viện trưởng | Quản lý tài nguyên và phát triển bền vững |
PHÒNG HÀNH CHÍNH TỔNG HỢP
| Stt | Họ và tên | Chức vụ | Chuyên môn |
| 1 | Phạm Việt Hùng | Trưởng phòng | Địa lý cảnh quan |
| 2 |
PHÒNG QUẢN LÝ KHOA HỌC CÔNG NGHỆ VÀ ĐÀO TẠO
| Stt | Họ và tên | Chức vụ | Chuyên môn |
| 1 | Trần Thu Phương | Phụ trách phòng | Phát triển quốc tế |
| 2 |
PHÒNG HỢP TÁC VÀ PHÁT TRIỂN
| Stt | Họ và tên | Chức vụ | Chuyên môn |
| 1 | Lê Thị Vân Huệ | Phụ trách phòng | Quy hoạch vùng và đô thị |
| 2 |
PHÒNG CHUYÊN MÔN
| Stt | Tên Phòng | Họ và tên | Chức vụ | Chuyên môn phụ trách phòng |
| 1 | Phòng Tài nguyên Thiên nhiên và Bảo tồn | PGS.TS. Lê Đức Minh | Trưởng phòng | Bảo tồn đa dạng sinh học |
| 2 | Phòng NC Biến đổi toàn cầu và Phát triển bền vững | TS. Võ Thanh Sơn | Trưởng phòng | Quản lý tài nguyên và phát triển bền vững |
| 3 | Phòng nghiên cứu Đất ngập nước và Biển đảo | TS. Hà Thị Thu Huế | Phụ trách phòng | Du lịch Sinh thái |
| 4 | Phòng Nghiên cứu hệ sinh thái rừng ngập mặn | TS. Lê Hương Giang | Trưởng phòng | Công nghệ Sinh học |
| 5 | Phòng Nghiên cứu tổng hợp và công nghệ Môi trường | TS. Đào Minh Trường | Trưởng phòng | Công nghệ GIS viễn thám |
